Hvorki afrísk-miðlæga S47 né P72 afbrigðið af TP53 er tengt minni hættu á hitaveiki í malarískri hóprannsókn

Bakgrunnur. Sýnt hefur verið fram á að TP53 gegnir hlutverki í bólguferlum, þar á meðal malaríu. Við komumst áður að því að p53 dregur úr bólgu af völdum sníkjudýra og spáir fyrir um klíníska vernd gegn Plasmodium falciparum sýkingu hjá malískum börnum. Hér könnuðum við hvort p53 codon 47 og 72 polymorphisms tengist mismunandi hættu á P. falciparum sýkingu og óbrotnum malaríu í ​​tilvonandi hóprannsókn á malaríuónæmi.

Aðferðir. Fjölbreytni p53 codon 47 og 72 voru ákvörðuð með raðgreiningu TP53 exon 4 í 631 malískum börnum og fullorðnum sem tóku þátt í Kalifabougou hóprannsókninni. Áhrif þessara fjölbreytileika á væntanlega hættu á malaríu með hita, tilfallandi sníkjudýrabólgu og tíma fram að hita eftir tilvik sníkjudýra yfir 6 mánaða mikla malaríusmit voru metin með því að nota Cox hlutfallshættulíkön.

Hvað gerir cistanche herb-Anti-bólgueyðandi

Niðurstöður. Hættan á malaríu, þar með talið aldur og blóðrauða S eða C, voru svipaðir hjá einstaklingum með eða án p53 S47 og R72 fjölbreytileika. Hvorki S47 né R72 tengdist mismunandi hættu á malaríu með hita, sníkjudýrafbrigði eða malaríu með hita eftir sníkjudýr.

Ályktanir. Þessar niðurstöður benda til þess að p53 codon 47 og 72 fjölbreytni tengist ekki vernd gegn P. falciparum sníkjudýrum eða óbrotnum hitamalaríu.

cistanche viðbótarbætur—Anti-bólgueyðandi

Leitarorð. malaría; P47S; p53 fjölbreytni; P72R; tilvonandi hóprannsókn.

Klínískt mikilvægasti malaríuvaldurinn í Afríku, Plasmodium falciparum, hefur sýkt menn í næstum 10,000 ár [1]. Á þessum tíma hefur há dánartíðni alvarlegrar falciparum malaríu sett mikinn sértækan þrýsting á erfðamengi mannsins [2]. Sem slík hefur sértækum rauðkornafjölbreytni sem annars gæti verið skaðleg hýsilinn (td sigðhemóglóbín [HbS] stökkbreyting sem ber ábyrgð á sigðfrumusjúkdómum) verið viðhaldið í malaríu landlægum þýðum þar sem þessar stökkbreytingar veita malaríuþol með því að gera rauðkornið minna gestkvæmt fyrir innrásarsníkjudýrið [3–5]. Sambandsrannsóknir á erfðamengi hafa bent á fleiri fjölbreytileika sem ekki tengjast starfsemi rauðkorna sem verndandi gegn alvarlegri malaríu, en allt að 89% af næmi fyrir alvarlegri malaríu hefur enn ekki verið rakið til sérstakra erfðafræðilegra staðsetningar [6-9]. Ennfremur hefur skort sönnunargögn fyrir fjölbrigðum rauðkorna hýsils sem gætu verið verndandi gegn óbrotnum (ekki alvarlegri) malaríu. Fyrri rannsóknir hafa tengt æxlisbælinguna p53 við stjórn malaríusýkingar. Sýnt hefur verið fram á að aukinn hýsil p53 dregur úr Plasmodium lifrarstigi byrði í músum [10]. Hópurinn okkar sýndi áður aukna tjáningu á TP53 og p53 markgenum í blóði ósýktra malískra barna sem áttu síðar eftir að sýna einkennalausa P. falciparum sníkjubólgu miðað við þau sem síðar fengu hitamalaríu [11]. Þessar athuganir hafa leitt til þeirrar spurningar hvort TP53 fjölbreytni gæti skýrt þennan mun á klínískri svipgerð. TP53 er algengasta stökkbreytta genið í krabbameinum í mönnum, þar sem meirihluti missense stökkbreytinga eiga sér stað á heitum reitum innan annað hvort prólínríka lénsins (amínósýrur 55-100) eða DNA-bindingarsvæðisins (amínósýrur 102-192) [12, 13]. Algengasta náttúrulega stökkbreytingin á sér stað við kódon 72 (rs1042522), sem stafar af einkirnisfjölbreytni (SNP) í exon 4 [14, 15]. Prólínleif í þessari stöðu (P72), talin forfeðraformið, finnst helst í einstaklingum af afrískum uppruna, en arginínleifar (R72) koma oftar fyrir hjá hvítum Bandaríkjamönnum og Evrópubúum sem ekki eru rómönsku, þar sem tíðnin eykst línulega með breiddargráðu [ 16, 17]. Þrátt fyrir að skipting á prólíni með arginíni leiði til marktækra byggingar- og virknibreytinga [18], er talið að báðar leifarnar virki nægilega til að vernda gegn mismunandi krabbameinum sem einstaklingar geta lent í á viðkomandi breiddargráðum (skoðað í [13]). Sérstaklega er R72 afbrigðið tengt köldu hitastigi og lágum UV styrkleika [19], en rannsóknir sem meta tengsl codon 72 fjölbreytileika við húðkrabbamein hafa leitt í ljós ósamræmi [20-23]. Þrátt fyrir aukna tíðni P72 meðal Afríkubúa miðað við Evrópubúa [17] hefur það verið lagt til af öðrum að R72 afbrigðið gæti verið verndandi gegn malaríusýkingu í mönnum [24], byggt á vísbendingum um að R72 hafi aukið apoptotic möguleika miðað við P72 [24] 25] og að frumudauði er aðferð þar sem hýsilinn útrýmir sníkjudýrum lifrarfrumum í lifur [10]. Næstalgengasta p53 kóða SNP kemur einnig fram í exon 4 og er staðbundið innan svæðisins sem kóðar N-enda transactivation lénið við codon 47 (rs1800371) [26], þar sem algengara prólíninu (P47) er hægt að skipta út fyrir serín (S47) ) [27]. Öfugt við mjög algenga fjölbreytileika við kódon 72, er S47 afbrigðið tiltölulega sjaldgæft hjá mönnum, með samsætutíðni 2%-4% í Afríkubúum [26, 27]. Þar sem S47 hefur ekki enn fundist hjá Bandaríkjamönnum af öðrum uppruna en afrískum uppruna [28] hefur verið vísað til þessa fjölbreytileika sem Afríkumiðlæga afbrigðið í bókmenntum. S47 afbrigðið getur veitt ónæmi fyrir járnháðum forrituðum frumudauða (ferroptosis), sem leiðir til aukinnar hættu á sjálfkrafa krabbameini [27, 29]. Hjá S47 músum getur þessi gallaða ferroptosis leitt til járnsöfnunar og bólgueyðandi svörunar við malaríulitarefninu hemozoin, sem leiðir til vangaveltna um að S47 afbrigðið geti takmarkað bólgu af völdum malaríu og þannig bætt lifun einstaklinga sem búa á svæðum með mikla malaríusmit [ 30]. Rannsóknir á p53 fjölbreytileika og malaríunæmi hjá mönnum hafa verið takmarkaðar hingað til. Tvær rannsóknir hafa kannað tengslin á milli codon 72 afbrigða og malaríuhættu hjá mönnum með misvísandi niðurstöðum [24, 31]. Hins vegar, að því er við vitum, hefur enn ekki verið rannsakað tengsl milli p53 codon 47 fjölbreytileika og malaríuhættu hjá mönnum. Í núverandi rannsókn skoðuðum við hvort p53 codon 47 og 72 fjölbreytni hafi áhrif á hættuna á P. falciparum sýkingu og klínískri malaríu í ​​væntanlegum hópi malískra barna og fullorðinna.

cistanche tubulosa - bólgueyðandi

Smelltu hér til að skoða Cistanche vörur

【Biðja um meira】Netfang:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

AÐFERÐIR

Námshönnun og þátttakendur

Rannsóknarstaðnum og rannsóknarþýðinu hefur verið lýst annars staðar [32]. Í stuttu máli var rannsóknin gerð í þorpinu Kalifabougou, Malí, þar sem P. falciparum malaríusmit er mikil og árstíðabundin, á sér stað frá júní til desember [32]. Í maí 2011 skráðum við 695 heilbrigð börn og fullorðna, á aldrinum 3 mánaða til 25 ára, í langvarandi athugunarhóprannsókn til að rannsaka malaríuónæmi, þar sem virkt malaríueftirlit var framkvæmt á tveggja vikna fresti með vikulegum heimaskoðunum og óvirku eftirliti af sjálfu sér. -tilvísun. Útilokunarviðmið við innritun voru meðal annars blóðrauðagildi<7 g/dL, axillary temperature >37.5°C, acute systemic illness, underlying chronic disease, use of antimalarial or immunosuppressive medications in the past 30 days, and pregnancy. Malaria episodes were defined as parasitemia of >2500 sníkjudýr á hvern míkrólítra, hitastig í handarkrika sem er hærra en eða jafnt og 37,5 gráður innan 24 klukkustunda og engin önnur orsök hita sem greina má með líkamlegri skoðun. Þættir greindust framvirkt með sjálftilvísun til rannsóknarstofu og vikulegum virkum klínískum eftirlitsheimsóknum. Allir einstaklingar með merki og einkenni malaríu og hvers kyns stig sníkjulækkunar sem greindust með smásjá voru meðhöndlaðir í samræmi við leiðbeiningar malaríuvarnaráætlunarinnar. Í áætluðum heilsugæsluheimsóknum var blóði safnað með fingurstungum á 2ja vikna fresti fyrir blóðstrok og þurrkaðir blóðblettir (DBS) á síupappír. Einkennalausar P. falciparum sýkingar greindust með smásjárskoðun á blóðstrokum og pólýmerasa keðjuverkun (PCR) greiningu á blóðblettum í lok eftirlitstímabilsins. Fyrstu P. falciparum sýkingar greindust afturvirkt með PCR á lengdarsöfnuðum DBS, eins og lýst er annars staðar [32]. Fyrstu malaríutilfellin voru ákvörðuð út frá klínískum heimsóknargögnum. Blóðrauðagildi, mæld með HemoCue greiningartæki, voru notuð til að ákvarða blóðleysisstöðu, byggt á forsendum Alþjóðaheilbrigðismálastofnunarinnar. Blóðrauðaflokkun fyrir HbS var framkvæmd með D-10 blóðrauðaprófunarkerfi (Bio-Rad). Þremur klínískum flokkum með mismunandi stig klínísks ónæmis var lýst annars staðar [11].

DNA einangrun og raðgreining

Erfðafræðilegt DNA var dregið úr heilblóðsýnum með því að nota 3 aðferðir: (1) úr heilblóðskögglum (100 μL) með því að nota QIAamp 96 DNA blóðsett (Qiagen), samkvæmt samskiptareglum framleiðanda; (2) frá DBS með QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen), samkvæmt samskiptareglum framleiðanda; eða (3) frá DBS með sérsniðinni útdráttaraðferð með mikilli afköst, eins og lýst er annars staðar [33]. Hreinsað erfðafræðilegt DNA var notað til að magna upp exon 4 af TP53 með PCR með því að nota eftirfarandi áður birtar frumur [34]: 5'-TGAGGACCTGGTCCTCTGAC- 3' (áfram) og afturábak 5'-AGAGGAATCCCAAAGTTC CA-3' ( afturábak). PCR mögnun var framkvæmd með því að nota HotStarTaq Plus Master Mix Kit (Qiagen) við 60 gráðu hitastig, samkvæmt ráðlögðum samskiptareglum framleiðanda. Magnaðar PCR vörur voru hreinsaðar og raðgreindar með keðjulokunaraðferðinni hjá Quintara Biosciences. Raðaskrár sem berast voru greindar með Benchling hugbúnaði (2022.2.3 útgáfu; https://benchling.com) og samræmdar við TP53 viðmiðunarröðina (genaauðkenni 7157; National Center for Biotechnology Information). Grunnsímtöl sem hugbúnaðurinn greindi frá voru handvirkt athugaðar á móti litskiljunum. Myndaðar raðir verða fáanlegar á GenBank (aðgangsnúmer OP593553–OP594185).

Tölfræðigreining

Kaplan-Meier ferlar voru notaðir til að áætla viðkomandi líkur á því að vera áfram laus við (1) klíníska malaríu, (2) P. falciparum sníkjudýr eða (3) malaríu með hita þegar sníkjudýr hafa orðið fyrir. Fyrir tíma þar til malaría með hita þegar sníkjudýr lækkuðu, var tíminn fyrir sníkjudýrafæð, metinn sem miðpunktur á milli síðustu neikvæðu P. falciparum PCR niðurstöðu og fyrstu jákvæðu P. falciparum PCR niðurstöðu, notaður sem upphafstími. Cox hlutfallshættulíkön voru notuð til að áætla Wald tölfræðina til að prófa þýðingu tímamuns til fyrsta atburðar milli TP53 afbrigða við kódon 47 eða 72 í annað hvort einþátta greiningum eða greiningum sem innihéldu fylgibreytur eins og gefið er til kynna í töflunum. Kruskal-Wallis raðsummuprófið var notað til að bera saman muninn milli hópa fyrir samfelldar niðurstöður. Fyrir flokkabreytur var hópasamanburður gerður með χ 2 prófum. Tölfræðileg marktækni var skilgreind sem 2-halað P-gildi<.05. All analyses were performed using R software (version 4.2.0).

cistanche plöntuaukning ónæmiskerfi

Siðferðilegt samþykki

Kalifabougou hóprannsóknin var samþykkt af siðanefnd læknadeildar, lyfjafræði- og tannlæknadeildar Háskólans í vísinda, tækni og tækni í Bamako, og stofnanaendurskoðunarráði National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institute of Health. . Skriflegt upplýst samþykki var fengið frá fullorðnum þátttakendum og foreldrum eða forráðamönnum þátttökubarna. Þessi rannsókn var samþykkt sem undanþegin rannsókn á mönnum af Indiana University Institutional Review Board (bókun 2005922267).

NIÐURSTÖÐUR

Tíðni TP53 fjölbrigða meðal þátttakenda í rannsókninni

Af þeim 695 einstaklingum sem upphaflega voru skráðir í Kalifabougou hópinn höfðu 631 nægjanlegt erfðafræðilegt DNA fyrir TP53 exon 4 raðgreiningu. Röðröðun leiddi í ljós 40 einstaklinga (6,3%) með S47 fjölbreytileika, þar af 33 arfblendnir og 7 arfhreinir (tafla 1). R72 fjölbreytni komu fram hjá 327 einstaklingum (51,8%), þar af voru 206 (32,6%) arfblendnir og 121 (19,2%) arfhreinir (tafla 1). Hvorki codon 47 né codon 72 polymorphisms voru í Hardy-Weinberg jafnvægi (Haldane nákvæma próf, P=6.5 × 10−6 og P=1.0 × 10−12, í sömu röð). Dreifing mögulegra áhrifavalda á malaríuáhættu (aldur, kyn, HbS eða blóðrauða, núverandi P. falciparum sníkjudýr og blóðleysi) var ekki marktækur munur meðal TP53 afbrigðishópanna fyrir annað hvort S47 eða R72 (tafla 1). Allir 6 einstaklingar sem voru arfblendnir fyrir bæði S47 og R72 samsæturnar voru karlkyns og PCR jákvæðir fyrir P. falciparum við skráningu (tafla 1).

Engin tengsl TP53 Codon 47 og Codon 72 fjölbreytileika með minni hættu á klínískum malaríuþáttum eða atviki P. falciparumSníkjudýr

Tímagreiningar voru gerðar til að kanna tengsl S47 og P72 afbrigða og hættu á malaríu með hita. Upphafsgreiningin á milli P47/P47, P47/S47 og S47/S47 sýndi engan marktækan mun á malaríuhættu (gögn ekki sýnd), væntanlega vegna lítillar sýnastærðar fyrir arfblendna P47/S47 og arfhreina S47/S47 arfgerðina. Þannig hrundu þessar arfgerðir saman í eitt lag. Fyrir kódon 72 var arfblendnu og arfhreinu arfgerðunum haldið sem 3 aðskilin jarðlög. Enginn marktækur munur var á tíma fram að fyrsta klíníska malaríukasti milli P47/P47 (miðgildis [95% öryggisbils], 184 [165–210] dagar) og S47 afbrigðisins (151 [133–210] dagar) arfgerða eða á milli P72/P72 (183 [59–210] dagar) og annað hvort P72/R72 (210 [160–210] dagar) eða R72/R72 (159 [142–210] dagar) arfgerðir í annaðhvort einbreytu greiningunum (Mynd 1A og 1B ) eða leiðréttu greiningunum sem innihéldu aldur, kyn, grunnlínu sníkjufall, blóðleysi og tilvist HbS sem fylgibreytur (viðbótartafla 1). Einstaklingar sem voru P47/S47 og P72/R72 sýndu svipaða hættu á klínískri malaríu og P47/P47 og P72/P72 arfhreinir einstaklingar (viðbótarmynd 1). Sýnt hefur verið fram á að aukið p53 dregur úr Plasmodium lifrarstigi byrði í músalíkönum [10]. Við ákváðum því hvort TP53 fjölbreytni tengdist mismunahættu á P. falciparum sýkingum eins og ákvarðað var með öflugu, virku PCR eftirliti hjá einstaklingum sem hófu rannsóknina neikvæða fyrir P. falciparum með PCR (n=330). Við fundum ekki marktækan mun á tíma fram að fyrstu P. falciparum sýkingu sem greinist með PCR á milli P47/P47 (miðgildi [95% öryggisbil], 85 [81–91] dagar) og S47 afbrigðis (85 [58–124] daga) arfgerða eða á milli P72/P72 (88 [80–95] dagar) og annað hvort P72/R72 (81 [72–91] dagar) eða R72/R72 (91 [80–116] dagar) arfgerða í annarri hvorri einþáttagreiningu ( mynd 1C og 1D) eða leiðréttar greiningar sem innihéldu viðeigandi fylgibreytur (viðbótartafla 2).

Engin tengsl TP53 fjölbrigða með vörn gegn malaríu með hita eftir atvik P. falciparum sníkjudýr eða mismunur á genatjáningu

Hópurinn okkar greindi áður undirhóp barna innan Kalifabougou árgangsins sem voru kvilla á þeim tíma sem atvikið átti sér stað, PCR-staðfest P. falciparum parasitemia [11]. Þessi börn voru flokkuð sem „seinkaður hiti“ eða „ónæmi“ eftir því hvort þau voru komin í hita eftir 2–14 daga eða voru einkennalaus það sem eftir lifði malaríutímabilsins. Þessir 2 undirhópar sýndu aukna tjáningu TP53 og TP53 markgena við upphaf sýkingar miðað við börn sem voru með hita þegar P. falciparum parasitemia („snemma hiti“) átti sér stað [11]. Til að ákvarða hvort TP53 fjölbreytileikar tengdust annað hvort seinkuðum hita eða ónæmissvipgerðum, skoðuðum við dreifingu S47 og R72 fjölbreytileika í þessum undirhópum en sáum ekki neinn marktækan mun á 3 klínísku svipgerðunum (tafla 2). Endurskoðun á TP53 tjáningu í RNA-seq umritum sem fengust við heilbrigða grunnlínu hvers barns (n ​​= 80) [11] með kódon 47 og 72 fjölbrigðum leiddi í ljós engan mun á algengum fjölbrigðum og viðkomandi afbrigðum (mynd 2). Til að ákvarða hvort S47 eða P72 afbrigði tengist vörn gegn malaríusótt þegar sníkjudýr hafa orðið í foreldrahópnum, ákváðum við hættuna á malaríu með hita, með því að nota tíma fyrsta sníkjubólgu sem upphafstíma. Hér tóku við alla einstaklinga sem hófu rannsóknina P. falciparum neikvæða með PCR og höfðu í kjölfarið PCR-staðfesta P. falciparum sníkjudýr (n=292). Enginn marktækur munur á tíma fram að fyrsta hita eftir sníkjudýramyndun kom fram í undirhópum með S47 eða P72 fjölbreytileika miðað við sameiginlegar arfgerðir þeirra með einbreytilegum greiningum (myndir 3A og 3B). Þrátt fyrir að það hafi verið tilhneiging til aukinnar hættu á malaríu með hita þegar S47 hefur verið sníkjudýr samanborið við P47/P47 (Mynd 3A), varð þessi munur tölfræðilega ómarktækari þegar leiðrétt var fyrir viðeigandi fylgibreytum eins og aldri og HbS (viðbótartafla 3).

UMRÆÐA

Öfugt við alvarlega malaríu hafa erfðafræðileg fjölbreytni hýsils sem tengist ónæmi gegn óbrotnum malaríu fyrst og fremst falið í sér afbrigði rauðkorna gena [2, 5]. Þar sem nokkur erfðaefni sem ekki eru rauðkorn hafa verið tengd vörn gegn alvarlegri malaríu [6, 7, 9], hafa aðeins örfá gena sem taka þátt í bólgusvöruninni, þ.e. NOS2 og TNF, verið sérstaklega tengd mismunahættu á óbrotinni eða vægri malaríu. [2, 35–38]. Umritunarþátturinn p53 viðheldur frumujafnvægi til að bregðast við streitumerkjum með því að stjórna margs konar niðurstreymismarkmiðum, þar á meðal bólguferlum, sem saman bæla krabbameinsvaldandi ferla [39]. Krabbameinsvaldandi möguleiki langvinnrar bólgu er vel þekktur [40], og það eru vaxandi vísbendingar um að p53 geti stillt hýsilbólgu í samhengi við sýkla [41, 42]. Þessu til stuðnings tók hópurinn okkar áður eftir því að aukin tjáning á TP53 og niðurstreymismarkmiðum þess tengdist hitavörn meðan á tilviki P. falciparum sníkjudýra stendur, sem bendir til þess að p53 gæti upphaflega dregið úr hitasvöruninni við malaríusýkingu [11]. Í fyrri rannsókn sýndu mýs með p53 S47 afbrigðið bólgueyðandi svörun við malaríulitarefninu hemósóíni, sem bendir til þess að sértæk p53 fjölbreytni gæti takmarkað bólgu við malaríusýkingar í mönnum [30]. Í tengslum við bólguáskorun með lípópólýsykru, sýndu mýs með p53 R72 fjölbreytileikann aukna lifun miðað við P72 mús, sem gefur til kynna að R72 afbrigðið gæti verndað gegn meinafræðilegum viðbrögðum við gram-neikvæðum bakteríum [43]. Hér var metið hvort fjölbreytileiki kódon 47 eða 72 hafi áhrif á hættuna á P. falciparum malaríu í ​​væntanlegum lengdarárgangi og sýndum að hvorug þessara fjölbrigða tengist mismunahættu á sníkjudýrum eða malaríu með hita. Þar að auki var hvorugt þessara TP53 fjölbreytileika ofboðið meðal undirhóps barna sem voru vernduð gegn malaríusótt og sem sýndu aukna tjáningu TP53 og markmið þess við upphaf sýkingar í fyrri rannsókn hópsins okkar [11]. Niðurstöður okkar eru í samræmi við þversniðsrannsóknir á frumburðarkonum frá Ghana (n=314) og börn í Rúanda (n=545), sem sýndu engin tengsl á milli R72 fjölbreytileika og algengi P. falciparum sýkinga eða styrkleika sníkjudýra. [31]. Eina önnur birta rannsóknin á p53 fjölbrigðum í malaríu var rannsókn á nýburum á Sardiníu, sem fann hærri tíðni hinnar meintu malaríuverndandi R72 arfhreinna arfgerð á svæði með áður hærra landlægni malaríu (n=46) miðað við svæði með áður minni landlægni malaríu (n=47) [24]. Byggt á þeirri forsendu að R72 afbrigði af p53 hafi aukið apoptotic möguleika [25] og gæti þannig komið í veg fyrir sýkingu á lifrarstigi með frumufrumu á sníkjudýrum lifrarfrumum [10], bentu höfundarnir á að malaríu landlægni gæti hafa verið valið jákvætt fyrir R72 fjölbreytileika [24] ]. Hins vegar er þessi tilgáta ekki studd af gögnum okkar sem sýna engan mun á tímanum þar til PCR-staðfest sníkjudýr koma upp á milli kódon 72 arfgerða. Að auki gæti malaríuverndandi R72 fjölbreytni ekki útskýrt hvers vegna P72 samsætan er algengari í Afríkubúum en Evrópubúum [17], athugun sem myndi gefa til kynna P72 sem samsætuna sem valin var til að viðhalda í malaríu landlægum stofnum samkvæmt " malaríutilgátu“ [8]. Það kann að vera að starfræn virkni sem R72 veitir hafi ekki þýðingu fyrir hættuna á malaríu með hita. Eins og fram kemur hér að ofan, þó að R72 afbrigðið gæti verndað mýs gegn lípópólýsykruáskorun [43], hefur það einnig verið sýnt fram á að það ýtir undir bólgu í tengslum við fituríkt mataræði [44] eða brjóstakrabbamein [45] í músarannsóknum. Þannig hvernig R72 fjölbreytni hefur áhrif á bólgusvörun getur verið háð bæði gerð og skerpu truflunarinnar.

Tafla 1. Hugsanlegir truflanir á malaríuáhættu og TP53 arfgerðum

Figure 1. p53 Codon 47 and 72 polymorphisms and malaria risk in the Kalifabougou cohort during the 2011 malaria season. Kaplan-Meier curves of time to first febrile malaria episode (defined as >2500 parasites per microliter by blood smear and axillary temperature >37,5 gráður ) (A, B) og tími til fyrstu pólýmerasa keðjuverkunar (PCR) – staðfest Plasmodium falciparum sníkjudýr (C, D), lagskipt eftir tilgreindum p53 afbrigði arfgerðum. Fyrir C og D náði greiningin aðeins til einstaklinga sem byrjuðu malaríutímabilið sem var neikvæð fyrir P. falciparum með PCR. Marktekt var ákvörðuð með Cox hlutfallslegum hættum með því að nota Wald prófunartölfræðina. Töflur sýna fjölda einstaklinga í hættu á tilgreindum dögum frá skráningu. Skammstöfun: HR, hættuhlutfall.

Tafla 2. Dreifing TP53 arfgerða meðal barna með mismunandi næmi Febrile malaríu eftir upphaflega Plasmodium falciparum Parasitemia

Mynd 2. TP53 tjáning með codon 47 og 72 fjölbrigðum. Tjáning TP53 með tilgreindum p53 codon 47 (A) og 72 (B) fjölbreytileika í heilblóðsýnum frá 80 malískum börnum við heilbrigða, ósýkta grunnlínu þeirra í maí 2011, fyrir malaríutímabilið [11]. Mikilvægi var ákvarðað með Wilcoxon prófinu (A) eða dreifnigreiningu (B). Genatjáning er tilkynnt sem log2 talningar á milljón (CPM).

Skortur á tengslum milli annaðhvort codon 47 eða codon 72 afbrigði og vernd gegn malaríu gæti einnig skýrst af skorti á áhrifum þeirra á p53 tjáningu eins og sést í gögnum okkar (Mynd 2) og fyrri rannsóknum [27, 46]. Ein helsta niðurstaða fyrri rannsókn hópsins okkar var að tjáning á p53 og niðurstreymismarkmiðum þess var aukin hjá börnum sem voru vernduð fyrir snemma hita meðan á sníkjudýrum stóð [11], sem bendir til þess að framkalla p53 tjáningu gæti þurft til að stjórna bólgu. Þrátt fyrir að S47 afbrigðið dragi úr getu til að framkalla frumudauða miðað við P47, er p53 próteintjáning innan frumunnar enn haldið á svipuðum stigum [27]. Þetta, ásamt þeirri athugun að ekkert barnanna í mest vernduðu „ónæmis“ hópnum hafi S47 afbrigðið, bendir til þess að minnkun á frumudauða vegna þessa fjölbreytileika sé ólíklegt hvernig p53 hefur áhrif á malaríusótt. Að sama skapi er R72 fjölbreytileiki virkni marktækur en leiðir ekki endilega til aukinnar p53 tjáningar [25, 46]. Sértækir kraftar geta aukið tíðni kjörsamsæta með tímanum. S47 samsætan var til staðar í 6,3% þátttakenda sem voru metnir, þar sem 1,1% voru arfhreinir, sem gefur samsætutíðni upp á 3,7%, sem er í samræmi við 2%–4% sem áður var greint frá fyrir Afríkubúa frá Afríku sunnan Sahara [28]. Aftur á móti var R72 samsætan til staðar í 51,8% þátttakenda (19,2% arfhreinir), sem gefur samsætutíðni upp á 35,5% í þessum hópi. Yfirgnæfandi samsæta P72 í malíska hópnum er í samræmi við aukna tíðni þessarar samsætu á breiddargráðum nær miðbaug, niðurstaða sem hefur verið rakin til náttúruvals [17].

cistanche ávinningur fyrir karla styrkir ónæmiskerfið

Það er freistandi að velta því fyrir sér hvers vegna S47 samsætunni er haldið svona lágu meðal Afríkubúa. Í ljósi þess að S47 hefur minnkað apoptotic möguleika miðað við P47 [27] gæti lága tíðni S47 samsætunnar skýrst af líkamsræktarkostnaði sem hlýst af viðhaldi hennar vegna sértækra ókosta sem ekki tengjast sjúklegri bólgu meðan á malaríu stendur, svo sem aukin hætta á brjóstakrabbameini fyrir tíðahvörf. [47]. Hins vegar gæti S47 afbrigðið, með því að takmarka hemozoin-framkallaða bólgusvörun [30], samt verið verndandi gegn alvarlegri malaríu. Þar sem núverandi rannsókn var aðeins metin óbrotin P. falciparum malaríu, fjallaði hún ekki um hvort annað hvort þessara fjölbreytileika tengdist minnkun á alvarlegri malaríuhættu. Rétt er að taka fram hóflega marktæk tengsl milli tvöfalds arfblendnar (P47/S47 og P72/R72) og einkennalausrar P. falciparum sníkjudýra við skráningu í maí (tafla 1). Á svæðum með mikilli, árstíðabundinni malaríu, endurspeglar langvarandi einkennalaus P. falciparum sýking í lok þurrkatímabilsins hærra uppsafnað malaríuónæmi [48]. Vegna þess að þessir 6 tvöföldu arfblendnu einstaklingar eru með hærri miðgildi miðað við hina hópana, getur offramboð einkennalausrar sníkjudýra í þessari arfgerð einfaldlega verið tilviljunarkennd vegna fyrri útsetningar fyrir malaríu frekar en afleiðing af p53 fjölbrigðum. Nauðsynlegt væri að auka hóprannsóknir á fjölbrigðum codon 47 og 72 p53 og malaríuhættu til að staðfesta mikilvægi tvöföldu arfgerfunnar. Taka verður fram fleiri takmarkanir þessarar rannsóknar. Þrátt fyrir að rannsóknin okkar sé ein af stærri rannsóknum á p53 fjölbrigðum og malaríuhættu hingað til, voru aðeins 7 af 631 þátttakendum arfhreinir fyrir S47, sem takmarkaði vald okkar til að greina tengsl. Að auki metum við aðeins p53 fjölbreytni innan exon 4 og gætu því hafa misst af áhrifum annarra hugsanlegra viðeigandi stökkbreytinga, þar á meðal 3KR stökkbreytingarnar (K117R + K161R + K162R) sem taka þátt í p53 asetýlerunarstöðum [49]. Athygli vekur að við metum codon 117, sem er staðsettur á exon 4 og fannst aðeins lýsín vera til staðar. Við metum heldur ekki fjölbreytni á TP53 svæðum sem ekki eru kóðaðar eða í p53 eftirlitstækjum sem gætu haft áhrif á p53 á próteinstigi, svo sem MDM2 [28, 50]. Næstu kynslóðar raðgreiningaraðferðir sem meta alhliða fjölbreytni á 5′ og 3′ óþýddum svæðum sem og öll kóðunarsvæði fyrir TP53 og p53 eftirlitsstofnanir gætu tekið á þessum takmörkunum. Að lokum ákváðum við ekki hvort p53 arfgerðirnar væru mismunandi í tjáningu þeirra á p53 á frumustigi, sem gæti hafa veitt mikilvæga innsýn í hvort kódon 47 og 72 fjölbreytileiki gæti haft áhrif á p53-stýrðar leiðir. Í stuttu máli gefur núverandi rannsókn vísbendingar um að hvorki kódon 47 né kódon 72 afbrigði af p53 séu verndandi gegn malaríu eins og mælt er með tíma þar til P. falciparum sníkjudýr kemur upp og óbrotin malaríu með hita. Í ljósi lægri tíðni S47 samsætunnar í þessum hópi, þyrfti stærri rannsóknir til að staðfesta skort á tengslum S47 afbrigðisins við malaríuhættu.

Mynd 3. p53 Codon 47 og 72 fjölbreytni og hætta á hitamalaríu eftir atvik sníkjudýra. Kaplan-Meier sýnir tíma til fyrstu malaríu með hita með því að nota fyrstu pólýmerasa keðjuverkun-staðfest Plasmodium falciparum blóðstigssýkingu sem upphafstíma lagskipt eftir p53 codon 47 (A) eða codon 72 (B) fjölbreytileika. Marktekt var ákvörðuð með Cox hlutfallslegum hættum með því að nota Wald prófunartölfræðina. Töflur sýna fjölda einstaklinga í áhættuhópi á tilgreindum tíma frá skráningu. Skammstöfun: HR, hættuhlutfall.

Viðbótargögn

Viðbótarefni er fáanlegt á The Journal of Infectious Diseases á netinu. Samanstendur af gögnum sem höfundar hafa lagt fram til gagns fyrir lesandann, birt efni er ekki afritað og er alfarið á ábyrgð höfunda, þannig að spurningum eða athugasemdum ætti að beina til samsvarandi höfundar.

Skýringar

Viðurkenningar. Við viljum þakka þátttakendum rannsóknarinnar og stuðningsstarfsmönnum rannsókna í Kalifabougou og Bamako, Malí. Við erum líka þakklát Shanping Li, Emily LaVerriere og Daniel E. Neafsey fyrir að veita erfðafræðilegt efni og tæknilega leiðbeiningar.

Framlög höfunda. PDC og TMT hugsuðu verkefnið. SD, KK, AO, BT, PDC og TMT hönnuðu upprunalegu hóprannsóknina og SD, KK, AO og BT innleiddu hana. ELG framkvæmdi tilraunirnar. JB, AU, ELG og TMT framkvæmdu gagnagreininguna. PDC lagði til viðbótarúrræði. JB, PDC og TMT skrifuðu handritið. Allir höfundar lásu og samþykktu handritið.

Fyrirvari. Innihaldið er eingöngu á ábyrgð höfunda og er ekki endilega fulltrúi opinberra viðhorfa Heilbrigðisstofnunarinnar.

Fjárhagslegur stuðningur. Þessi vinna var studd af National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) og National Institute of Health (styrkir R01AI158719 og K08AI125682 til TMT). Kalifabougou hóprannsóknin er studd af innri rannsóknadeild NIAID.

Hugsanlegir hagsmunaárekstrar. Allir höfundar: Engir tilkynntir árekstrar. Allir höfundar hafa sent inn ICMJE eyðublaðið til að birta hugsanlega hagsmunaárekstra. Upplýst hefur verið um árekstra sem ritstjórar telja skipta máli varðandi innihald handritsins.

Heimildir

1. Sundararaman SA, Plenderleith LJ, Liu W, o.fl. Erfðamengi dulrænna simpansa Plasmodium tegunda sýna helstu þróunaratburði sem leiða til malaríu manna. Nat Commun 2016; 7:11078.

2. Kwiatkowski DP. Hvernig malaría hefur haft áhrif á erfðamengi mannsins og hvað erfðafræði mannsins getur kennt okkur um malaríu. Am J Hum Genet 2005; 77:171–92.

3. Allison AC. Vörn sem sigðfrumueigin veitir gegn malaríusýkingu. Br Med J 1954; 1:290–4.

4. Lell B, May J, Schmidt-Ott RJ, o.fl. Hlutverk fjölbrigða rauðra blóðkorna í ónæmi og næmi fyrir malaríu. Clin Infect Dis 1999; 28:794–9.

5. Lopera-Mesa TM, Doumbia S, Konate D, o.fl. Áhrif afbrigða rauðra blóðkorna á malaríu í ​​æsku í Malí: tilvonandi hóprannsókn. Lancet Haematol 2015; 2: e140–9.

6. Ravenhall M, Campino S, Sepulveda N, o.fl. Ný erfðafræðileg fjölbreytni í tengslum við alvarlega malaríu og undir sértækum þrýstingi í norðausturhluta Tansaníu. PLoS Genet 2018; 14:e1007172.

7. Ndila CM, Uyoga S, Macharia AW, o.fl. Fjölbreytni í genaframbjóðanda manna og hætta á alvarlegri malaríu hjá börnum í Kilifi, Kenýa: rannsókn á tilvikssamanburði. Lancet Haematol 2018; 5:e333–45.

8. Ebel ER, Uricchio LH, Petrov DA, Egan ES. Að endurskoða malaríutilgátuna: gera grein fyrir fjölgenum og pleiotropy. Trends Parasitol 2022; 38:290–301.

9. Malaríu erfðafræðileg faraldsfræðinet. Innsýn í næmi fyrir malaríu með því að nota gögn um erfðamengi um 17,000 einstaklinga frá Afríku, Asíu og Eyjaálfu. Nat Commun 2019; 10:5732.

10. Kaushansky A, Ye AS, Austin LS, o.fl. Bæling á hýsil p53 er mikilvæg fyrir Plasmodium lifrarsýkingu. Cell Rep 2013; 3:630–7.

11. Tran TM, Guha R, Portúgal S, o.fl. Sameindamerki í blóði sýnir hlutverk p53 við að stjórna bólgu af völdum malaríu. Ónæmi 2019; 51:750–65.e10.

12. Baugh EH, Ke H, Levine AJ, Bonneau RA, Chan CS. Af hverju eru stökkbreytingar á heitum reitum í TP53 geninu í krabbameinum í mönnum? Frumudauði munur 2018; 25:154–60.

13. Hoyos D, Greenbaum B, Levine AJ. Arfgerðir og svipgerðir missense stökkbreytinga í prólínsvæði p53 próteins. Frumudauði er mismunandi 2022; 29:938–45.

14. Harris N, Brill E, Shohat O, o.fl. Sameindagrundvöllur fyrir misleitni p53 próteins manna. Mol Cell Biol 1986; 6:4650–6.

15. Matlashewski GJ, Tuck S, Pim D, Lamb P, Schneider J, Crawford LV. Aðalbyggingarfjölbreytni við amínósýruleif 72 af p53 úr mönnum. Mol Cell Biol 1987; 7: 961–3.

16. Katkoori VR, Jia X, Shanmugam C, o.fl. Forspármikilvægi p53 codon 72 polymorphism er mismunandi eftir kynþætti í kirtilkrabbameini í ristli. Clin Cancer Res 2009; 15: 2406–16.

17. Beckman G, Birginder R, Sjalander A, o.fl. Er p53 fjölbreytni viðhaldið með náttúruvali? Hum Hered 1994; 44:266–70.

18. Thomas M, Kalita A, Labrecque S, Pim D, Banks L, Matlashewski G. Tvö fjölbreytileg afbrigði af villigerð p53 eru lífefnafræðilega og líffræðilega ólík. Mol Cell Biol 1999; 19:1092–100. 19. Shi H, Tan SJ, Zhong H, o.fl. Vetrarhiti og UV eru nátengd erfðafræðilegum breytingum á p53 æxlisbælandi ferli í Austur-Asíu. Am J Hum Genet 2009; 84:534–41.

20. McGregor JM, Harwood CA, Brooks L, o.fl. Tengsl p53 codon 72 fjölbreytni og næmi fyrir sólbruna og húðkrabbameini. J Invest Dermatol 2002; 119: 84–90.

21. Nan H, Qureshi AA, Hunter DJ, Han J. Samspil milli p53 codon 72 polymorphism og sortukortín 1 viðtaka afbrigði á sólbrúnskusvörun og hættu á sortuæxlum í húð. Br J Dermatol 2008; 159:314–21.

22. Cotignola J, Chou JF, Roy P, o.fl. Rannsókn á áhrifum MDM2 SNP309 og TP53 Arg72Pro fjölbrigða á upphafsaldur sortuæxla í húð. J Invest Dermatol 2012; 132:1471–8.

23. Liu T, Lei Z, Pan Z, o.fl. Erfðafræðileg tengsl milli p53 codon 72 polymorphism og hættu á flöguþekjukrabbameini í húð. Æxli Biol 2014; 35:3899–903.

24. Gloria-Bottini FMG, Saccucci P, Bottini E. P53 codon 72 og fyrri malaríusjúkdómar á Sardiníu. Malar Chemoth Cont Brotthvarf 2013; 2(1):107.

25. Dumont P, Leu JI, Della Pietra AC 3rd, George DL, Murphy M. Codon 72 polymorphic afbrigði af p53 hafa verulega mismunandi apoptotic möguleika. Nat Genet 2003; 33:357–65. 26. Felley-Bosco E, Weston A, Cawley HM, Bennett WP, Harris CC. Hagnýtar rannsóknir á kímlínufjölbreytni við kódon 47 innan p53 gensins. Am J Hum Genet 1993; 53:752–9.

27. Li X, Dumont P, Della Pietra A, Shetler C, Murphy ME. Codon 47 polymorphism í p53 er virkni marktækur. J Biol Chem 2005; 280:24245–51.

28. Barnoud T, Parris JLD, Murphy ME. Algeng erfðaafbrigði í TP53 ferlinu og áhrif þeirra á krabbamein. J Mol Cell Biol 2019; 11:578–85.

29. Jennis M, Kung CP, Basu S, o.fl. Afrísk sértæk fjölbreytni í TP53 geninu skerðir p53 æxlisbælandi virkni í músarlíkani. Genes Dev 2016; 30: 918–30.

30. Singh KS, Leu JI, Barnoud T, o.fl. Afrískt miðlægt TP53 afbrigði eykur járnsöfnun og bakteríusjúkdóma en bætir svörun við malaríueiturefni. Nat Commun 2020; 11:473.

31. Gai PP, Meese S, Bedu-Addo G, Gahutu JB, Mockenhaupt FP. Engin tengsl p53 codon 72 polymorphism við malaríu í ​​Ghanaian primiparae og Rúanda börnum. Am J Trop Med Hyg 2014; 90:1133–4.

32. Tran TM, Li S, Doumbo S, o.fl. Áfangsmikil langtímahóprannsókn á börnum og fullorðnum í Malí sýnir engar vísbendingar um áunnið ónæmi gegn Plasmodium falciparum sýkingu. Clin Infect Dis 2013; 57:40–7.

33. LaVerriere E, Schwabl P, Carrasquilla M, o.fl. Hönnun og innleiðing margfaldaðra amplicon raðgreiningarspjalda til að þjóna erfðafræðilegri faraldsfræði smitsjúkdóma: malaríutilviksrannsókn. Mol Ecol Resour 2022; 22: 2285–303.

34. Kawaguchi H, Ohno S, Araki K, o.fl. p53 Fjölbreytni í krabbameini í vélinda sem tengist papillomaveiru manna. Cancer Res 2000; 60:2753–5.

35. Kun JF, Mordmuller B, Perkins DJ, o.fl. Nituroxíðsyntasi 2Lambaréné (G-954C), aukin nituroxíðframleiðsla og vörn gegn malaríu. J Infect Dis 2001; 184:330–6.

36. Flori L, Delahaye NF, Írak FA, Hernandez-Valladares M, Fumoux F, Rihet P. TNF sem malaríuframbjóðandi gen: fjölbrigðaskimun og fjölskyldubundin tengslagreining á vægu malaríuáfalli og sníkjudýrum í Búrkína Fasó. Genes Immun 2005; 6:472–80.

37. Fugtagbi G, Otu PS, Abdul-Rahman M, et al. Samtök TNF-alfa, MBL2, NOS2 og G6PD með malaríuáhrifum hjá fólki í Suður-Gana. Genet Res (Camb) 2022; 2022:6686406.

38. Meyer CG, May J, Luty AJ, Lell B, Kremsner PG. TNFalpha-308A tengist styttri millibili Plasmodium falciparum endursýkinga. Vefjamótefnavakar 2002; 59:287–92.

39. Cooks T, Harris CC, Oren M. Caught in crossfire: p53 í bólgu. Krabbameinsvaldandi 2014; 35:1680–90.

40. Coussens LM, Werb Z. Bólga og krabbamein. Náttúra 2002; 420:860–7.

41. Madenspacher JH, Azzam KM, Gowdy KM, o.fl. p53 Samþættir vörn hýsils og örlög frumna við bakteríulungnabólgu. J Exp Med 2013; 210:891–904.

42. Menendez D, Shatz M, Azzam K, Garantziotis S, Fessler MB, Resnick MA. Toll-eins og viðtaka genfjölskyldan er samþætt í DNA skemmdum og p53 netkerfum manna. PLoS Genet 2011; 7:e1001360.

43. Frank AK, Leu JI, Zhou Y, o.fl. Codon 72 polymorphism p53 stjórnar samskiptum við NF-KB og umvirkjun gena sem taka þátt í ónæmi og bólgu. Mol Cell Biol 2011; 31:1201–13.

44. Kung CP, Leu JI, Basu S, o.fl. P72R fjölbreytileiki p53 veldur offitu og truflunum á efnaskiptum. Cell Rep 2016; 14:2413–25.

45. Gunaratna RT, Santos A, Luo L, o.fl. Hið kraftmikla hlutverk kódon 72 p53 einskirnisfjölbreytni í æxlismyndun brjóstakrabbameins í manngerðu músarlíkani. Oncogene 2019; 38:3535–50.

46. ​​Kim BY, Lee SY, Chung SK. Mismunandi umritunarstjórnun fjölbreytilegs p53 codon 72 í efnaskiptaferlum. Int J Mol Sci 2021; 22:10793.

47. Murphy ME, Liu S, Yao S, o.fl. Virka marktækt SNP í TP53 og hættu á brjóstakrabbameini hjá konum í Afríku-Ameríku. NPJ Brjóstakrabbamein 2017; 3:5.

48. Portúgal S, Tran TM, Ongoiba A, o.fl. Meðferð við langvarandi einkennalausri Plasmodium falciparum sýkingu eykur ekki hættuna á klínískri malaríu við endursýkingu. Clin Infect Dis 2017; 64:645–53.

49. Li T, Kon N, Jiang L, o.fl. Æxlisbæling án p53-miðlaðrar frumuhringsstopps, frumudauða og öldrunar. Cell 2012; 149:1269–83.

50. Grochola LF, Zeron-Medina J, Meriaux S, Bond GL. Einskirnisfjölbreytni í p53 boðleiðinni. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010; 2:a001032.