Auðkenning á hubgenum sem tengjast þróun bráðra nýrnaskaða

Tengiliður:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Xiao Lin Jianchun Li Ruizhi Tan Xia Zhong Jieke Yang Li Wang

Rannsóknarstofa í fyrirbyggjandi meðferð og meðferð með vefjagigt líffæra með því að sameina hefðbundna kínverska og vestræna læknisfræði, Rannsóknarmiðstöð samþættrar hefðbundinnar kínverskrar og vestrænnar læknisfræði, Tengt hefðbundin læknisfræðisjúkrahús, Southwest Medical University, Luzhou, Kína

magn cistanche umsagnir:mjög gott fyrirnýrnastarfsemi

Leitarorð

Vegin samtjáning gena netgreiningar·Bráðnýrumeiðsli·Rplp1.Lgals1

Ágrip

Bakgrunnur: Bráðnýrumeiðsli(AKI) er alvarlegt klínískt heilkenni, sem veldur djúpri læknisfræðilegri og félagslegri byrði um allan heim. Þessi rannsókn miðar að því að kanna undirliggjandi sameindamarkmið sem tengjast framvindu AKl. Aðferðir: Opinber gagnagrunnur er upprunninn úr NCBI GEO gagnagrunninum (raðnúmer: GSE121190) og notuð var rótgróin og óhlutdræg aðferð við vegið samtjáningarnetsgreiningu gena (WGCNA) til að bera kennsl á miðstöð gen og hugsanlegar leiðir. Ennfremur voru unbiasedhub genin staðfest í 2 klassískum gerðum af AKl í nagdýralíkani: efnafræðilega staðfest AKI með cisplatíni og blóðþurrð-endurflæði völdum AKI. Niðurstöður: Alls fengust 17 einingar að lokum með óhlutdrægri aðferð WGCNA, þar sem genin í grænblárri einingarnum sýndu sterka fylgni við þróun AKl. Auk þess leiddu niðurstöður genaverufræðinnar í ljós að genin í grænblárri einingunni tóku þátt í nýrummeiðsliog nýrnatrefjun. Þannig voru miðstöð genin staðfest frekar með tilraunaaðferðum og fengu fyrst og fremst Rplp1 og Lgals1 sem lykil umsækjenda gen sem tengjast framgangi AKI með kostinum á magnbundinni PCR, Western blotting og flúrljómun í vefjum á staðnum. Mikilvægt er að tjáning Rplp1 og Lgals1 á próteinstigi sýndi jákvæða fylgni við nýrnastarfsemi, þar á meðal Cr og BUN í sermi. Ályktanir: Með kostum óhlutdrægrar lífupplýsingaaðferðar og þar af leiðandi sannprófunar á tilraunum, leggur þessi rannsókn grunninn að meingerð og þróun meðferðarefna AKI.

Kynning

Bráðnýrumeiðsli(AKI) er algengt klínískt heilkenni, þar á meðal margs konar lífeðlisfræðilega ferla [1, 2]. Í raun er endurheimt nýrnastarfsemi í AKI oft ófullnægjandi og þróast smám saman yfir í langvinnan nýrnasjúkdóm, sem þróast að lokum í ESRD [3]. AKI er mikilvægur þáttur í langvinnum nýrnasjúkdómum og þar af leiðandi ESRD [4]. Í framvindu AKI umbreytinga yfir í langvinnan nýrnasjúkdóm, koma byggingarafbrigði fram sem útfelling fylkisþenslu í bæði mesangium og tubulointerstitium. Miðun

á bandvefsmyndun í nýrum eftir að AKI hefur verið talin vera meðferðaraðferð til að lágmarka umskipti [5-7].

Hækkað plasma Cr er talið vera klassískt viðmið til að greina AKI á undanförnum áratugum. En það er kannski ekki rétt lífmerki þar sem það bendir oft til jafnvægis í framleiðslu og útskilnaði Cr [8]. Þrátt fyrir að brýnt sé að útrýma skammtíma- og langtímaárangri AKI, eru lækningameðferðir og lífmerki snemma uppgötvun enn takmörkuð. Að auki eru engir klínískt gildar lífvísar fyrir greiningu á bandvefsmyndun í nýrum eftir AKI. Þess vegna er gagnlegt að þróa fleiri lækningameðferðir og reikna út hugsanleg lífmerki til að meðhöndla bandvefsbólgu og seinka framgangi [1, 8].

Vegna gallaðrar aðferðafræði sameindalíffræði eru enn ákveðnar takmarkanir á alhliða könnun á öllu líffræðilegu kerfi í sjúkdómum [9]. Sem kerfisbundin líffræðileg aðferð til að lýsa erfðafræðilegum tengslamynstrum milli mismunandi sýna, er vegin samtjáningarnetsgreining gena (WGC-NA) aðallega notuð til að skima og bera kennsl á mjög samvinnueiningar. Samkvæmt innri eiginleika einingarinnar og tengslin milli eininga og fyrirbæragerða hefur hún verið mikið notuð í rannsóknum á omics greiningu til að grafa út hugsanleg lífmerki eða meðferðarmarkmið [10-12]. Í samanburði við gögn sem einbeita sér eingöngu að mismunatjáningu hefur WGCNA eftirfarandi kosti: það getur nýtt sér upplýsingar til fulls, tengt áhugaverðar breytingar svipgerða og forðast galla við mismunatjáningargreiningu sem tilbúnar að setja viðmiðunarmörk. Það sem meira er, WGCNA getur ekki aðeins greint mRNA-magn sýna heldur einnig verið notað fyrir míkró-RNA og próteinfræðirannsóknir, sem er mjög gagnlegt við að finna hugsanleg líffræðileg merki og lækningaleg markmið [13, 14].

Í þessari rannsókn framkvæmdum við vel þekkta lífupplýsingaaðferð – WGCNA – til að greina tjáningarsniðið (NCBI GEO raðnúmer: GSE121190) og miðar að því að bera kennsl á hugsanlegar leiðir og gen sem tengjast framvindu AKI. Mikilvægt er að við notuðum tilraunaaðferðir til að sannreyna frekar miðstöð genin, til að veita nýja innsýn fyrir tilvik, þróun og meðferð AKI.

cistanche reddit nýrnalækningaaðferð

Efni og aðferðir

Forvinnsla gagna

Gagnasettið var fengið úr GEO gagnagrunninum. Í þessari rannsókn voru 12 sýni af GSE121190 gagnasettinu notuð fyrir WGCNA greiningu. Tólf sýni innihéldu samanburðarhópinn og fólínsýru-framkallaða 3-/7-/14-dags AKI hóp (3 sýni í hverjum hóp). R pakkinn "limma" er notaður fyrir bakgrunnsleiðréttingu og eðlileg vinnslu með upprunalegu gögnunum. Ef margar rannsaka passa við 1 gen er meðalgildi reiknað sem genatjáningargildi [9, 15].

Samtjáningarnetsbygging og virknigreining

Síðan er mjúki þröskuldurinn reiknaður út með WGCNA reikniritinu. Skalaóháð gildi og meðaltenging eininga undir mismunandi mjúkum þröskuldum voru prófuð með hallaaðferðinni til að ákvarða viðeigandi mjúka þröskuld [13, 16, 17]. Með því að velja viðeigandi mjúk þröskuldsgildi var samtjáningarnetið smíðað til að tryggja áreiðanleika niðurstaðnanna og lágmarksfjöldi gena í hverri einingu var ekki<30. then,="" use="" the="" r="" package="" "clusterprofiler"="" toolkit="" to="" perform="" go="" analysis="">

Staðfesting á Hub Gene

Næst greindum við miðstöð genin í samræmi við þröskuldgildi í hverri einingu og sýndum þau með Cytoscape hugbúnaði. Miðgenin voru meðhöndluð sem eftirfarandi viðmiðun: (a) algildi genamarktækni (GS), FA 3/7/14 dagar Stærra en eða jafnt og 0.2, og (b) genin í Aðaleiningin var greind með STRING gagnagrunninum til að búa til prótein-prótein víxlverkun (PPI) netið og efstu 5 genin með hæstu tengsl voru meðhöndluð sem miðstöð gen til frekari sannprófunar [20].

Dýralíkön af völdum cisplatíns og blóðþurrðarblóðþurrðar

Karlkyns C57BL/6 mýs (SPF stig, 6∼8-vikugamlar, 20∼25 g) voru keyptar frá Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd. (SCXK [Sichuan] 2015-030) og hýst og ræktuð við staðlaðar umönnunaraðstæður við tilraunadýramiðstöð Southwest Medical University (SYXK [Sichuan] 2018-065). Mýsnar

Mynd 1. Bygging á samvirkri tjáningareiningu. Clustering dendrogram af 12 sýnum. B Greining á staðfræði netkerfis fyrir ýmsa mjúka þröskulda (kraft). C Samtjáningareining smíðaður af kraftmiklu blendingsalgríminu. Sérhver laufhnútur táknar gen og mismunandi litir tákna mismunandi einingar í tréskýringunni.

voru flokkaðir í 3 hópa (n=6 í hverjum hópi): viðmiðunarhópur, Cis-AKI og IRI-AKI; músum í Cis-AKI hópnum var sprautað með cisplatíni (Sigma-Aldrich, Bandaríkjunum) (15 mg/kg) með inndælingu í kviðarhol [21]. Mýs í IRI hópnum voru svæfðar með 1% pentobarbital natríum og settar á lítið hitastillt rafmagnsteppi til að halda líkamshita við 36 gráður. Eftir svæfingu voru teknir tvíhliða hliðarskurðir og slagæðar þvingaðar

með slagæðaklemmum í 35 mín. Saltvatni var bætt við í dropatali til að halda ínýrurakt á 5 mín fresti. Eftir að slagæðaklemman var fjarlægð voru skurðirnir saumaðir og mýsnar settar í 37 gráðu umhverfi [22, 23]. Í lok tilraunatímabilsins voru mýsnar drepnar á 3. og 7. degi, í sömu röð. Blóðsýni úr músum voru

fengin fyrir leghálslosið. Allar tilraunaaðferðir voru samþykktar af siðanefnd Southwest Medical University (samþykkisnúmer: 201812-55).

Vefjafræðileg greining og greining á nýrnastarfsemi

Thenýruvar gert að paraffínsneiðum samkvæmt hefðbundnum aðferðum. Í stuttu máli, thenýruvefir voru festir með 10 prósent formaldehýði, þurrkaðir og felldir inn í paraffín [24]. Hlutarnir voru þurrkaðir og litaðir með hematoxýlíni og eósíni (Beyotime, Kína). Á endanum voru kaflarnir teknir upp með sýndarsmásjá (VS120-S6-W, Olympus, Japan). Á sama tíma voru sermi Cr og BUN mæld samkvæmt leiðbeiningum settsins (Nanjing JianCheng, Kína).

RNA einangrun og magn PCR

Heildar-RNA var dregið út með því að nota RNA-útdráttarsett (Tian-gen, Beijing) og viðbótar-DNA var fengið með því að nota öfugt umritunarsett (Promega, Shanghai, Kína) samkvæmt leiðbeiningum framleiðanda. Síðan var megindleg PCR framkvæmd í LightCycler® 480 II rauntíma PCR kerfi (Roche, Þýskalandi). Primers voru smíðaðir af Sangon Biotech (Shanghai, Kína) og raðir eru fáanlegar í töflu 1.

Western Blot

Heildarprótein voru einangruð og leyst upp í RIPA jafnalausn. Næst var próteinstyrkur greind með BCA próteingreiningarsetti (Beyotime Biotechnology, Kína). Próteinsýnin voru keyrð á 12 prósent natríumdódecýl súlfat-pólýakrýlamíð hlaupi og flutt yfir á PVDF himnur (Millipore, Danvers, MA, USA). Himnur voru stíflaðar með 5% sermi albúmíni úr nautgripum við stofuhita í 1 klst og ræktaðar við 4 gráður yfir nótt með tilgreindum frummótefnum: anti-Lgals1 (Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA, 1:1,{{10 }}) og and-Rplp1 mótefni (Invitrogen, Waltham, MA, USA, 1:500). Síðan voru PVDF himnur þvegnar með Tris-bufferðu saltvatns Tween og ræktaðar kl.

stofuhita í 1 klst með öðru mótefni (Invitrogen, Waltham, MA, USA; 1:10,000). Hljómsveitir voru sýndar með ECL Chemiluminescence Kit (Thermo, Waltham, MA, Bandaríkjunum) og greind með ImageJ hugbúnaði.

In situ ónæmisflúrljómun

Fyrir ónæmisflúrljómun í vefjum,nýruvefir voru festir með 10 prósent formaldehýðlausn og þurrkaðir, í sömu röð, með 10, 20 og 30 prósent súkrósa, fylgt eftir með innfellingu í OCT. Sýnin voru síðan gerð í 4-μm hluta og þvegin þrisvar sinnum með PBS í 5 mín. Vefirnir voru stíflaðir með 5 prósent BSA í 1 klst við stofuhita og síðan ræktaðir við 4 gráður yfir nótt með tilgreindum frummótefnum: and-Lgals1 (Cell Signaling Technology, Danvers, MA, USA; 1:200) og and-Rplp1 mótefni (Invitrogen, Waltham, MA, Bandaríkin; 1:100). Daginn eftir voru vefir þvegnir með PBS í 5 mínútur 3 sinnum, fylgt eftir með ræktun með Alexa Fluor® 488-conjugated secondary mótefni (Cell Signaling Technology, Danvers, MA, Bandaríkjunum; 1:200) og við stofuhita í 1 klst. Myndirnar voru teknar með sýndarsmásjá (VS120-S6-W, Olympus, Japan).

Tölfræðigreining

Rauntíma PCR og Western blot tölfræðilegar greiningar voru gerðar með GraphPad Prism 7.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, Bandaríkjunum). Einhliða ANOVA var notuð ef fleiri en 2 samanburðarhópar eru til. p < 0.05="" var="" talinn="" tölfræðilegur="">

Mynd 3. Hagnýtur greining á grænblárri einingunni. Niðurstöður auðgunargreiningar genaaðgerða af grænblárri einingunni. B PPI net miðstöð genanna í grænblárri einingunni og niðurstöðurnar voru sýndar með Cytoscape. PPI, prótein-prótein samskipti; ECM, utanfrumufylki.

Niðurstöður

Forvinnsla gagna

12 sýnin af fylkisgögnum í niðurhalaða gagnasettinu GSE121190 voru forunnin með limma pakkanum R tungumálsins. Til þess að fá gen sem tengjast AKI er nauðsynlegt að bera saman breytingar á genatjáningu milli venjulegra og AKI sýna og skima út 25 prósent gena fyrir dreifni. Fyrir vikið fengust alls 5.418 gen fyrir seinni WGCNA greiningu.

Smíði samvinnutjáningareiningar

Fyrst af öllu voru sýni fyrst sett í þyrping til að fjarlægja útlínur með R tungumál hclust tóli. Niðurstöðurnar eru sýndar á mynd 1A. Síðan mældum við sjálfstæði og meðaltengingu eininga við mismunandi þröskulda. Eins og sýnt er á mynd 1B, má dæma af myndinni að þegar þröskuldsgildið er jafnt og 8, sem gerir ekki aðeins meðaltengingarstig netsins ekki of lágt heldur tryggir það einnig að netið sem byggt er sé nálægt því kvarðalausu. net.

Í næsta skrefi breyttum við aðliggjandi fylki í staðfræðilegt skörunarfylki til að draga úr hávaða og fölskum fylgni. Akerfisþyrpingartré var komið á með staðfræðilegu skörunarfylki, eins og sýnt er á mynd 1C. Og fjöldi gena í hverri einingu var stilltur sem hvorki meira né minna en 30 með kraftmiklu blendingaskurðaralgríminu. Að lokum voru 17 einingar fengnar úr kerfisþyrpingatrénu og fjöldi gena sem eru í hverri samtjáningareiningu er sýndur í töflu 2.

Lykileiningar og miðstöð genskimun

Síðan greindum við efstu 3 einingarnar (brúnar, bláar og grænblár einingar) og leituðumst við að finna út miðstöð genin. Tjáningarmynstur gena í 3 einingunum voru greind. Eins og fram kemur á mynd 2 leiddi niðurstaðan í ljós að bláar og brúnar einingar eru í neikvæðri fylgni við AKI framvindu, en grænblár einingin er jákvæð fylgni við AKI framvindu. Við framkvæmdum síðan virknigreininguna í hverri einingu og komumst að því að genin sem eru í brúnu, bláu og grænbláu einingunum eru nákvæmlega tengd viðnýru, þróun kynfærakerfis, nokkur nauðsynleg efnaskiptaferli og útfelling utanfrumufylkis (ECM), sem eru nákvæmlega tengd bandvefsmyndun í nýrum; Sérstaklega er talið að grænblár einingin gegni mikilvægu hlutverki í þróun nýrnatrefjunar eftir AKI (upplýsingar sýndar á mynd 3A og sjá netviðauka mynd 1A, 2A; sjá www.karger.com/doi/ 10.1159/000511661 fyrir allt aukaefni á netinu). Við leituðum síðan að finna miðstöð gen í hverri einingu og eftir bráðabirgðasíun voru efstu 5 genin - Lgals1, Rplp1, Col3a1, Col6a2 og Mgp - í grænblárri einingunni meðhöndluð sem miðstöð gen (eins og sýnt er á mynd 3B). Við gerðum líka svipaða greiningu í bláu og brúnu einingunum en tókst ekki að finna miðstöð gen miðað við tjáningarmynstur þeirra og GS (eins og fram kemur í á netinu suppl. mynd. 1B, 2B).

Mat á vefjafræðilegri meinafræði og nýrum

Virka

Næst smíðuðum við Cis-AKI og IRI-AKI dýralíkön. Eins og sýnt er í netuppl. Mynd 3a, niðurstöður HE-litunar benda til þess að pípludrep hafi verið til staðar í Cis- AKI/IRI-AKI módelum, ogmeiðslivar áberandi með tímanum. Á sama tíma gátum við líka séð að í samanburði við samanburðarhópinn var hröð aukning á sermi Cr og BUN á tímaháðan hátt. Samanlagt bentu allar þessar niðurstöður til árangursríkrar smíði AKI dýralíkana.

Staðfesting á Hub Gene

Til að staðfesta enn frekar áreiðanleika WGCNA aðferðarinnar og skima miðstöð gen sem eru nátengd framvindu bandvefsmyndunar í nýrum, á ofangreindum grundvelli, ætluðum við að sannreyna tjáningu 5 efstu miðstöðvargena í Cis-AKI og IRI-AKI dýralíkönum með kostum. af rauntíma PCR, Western blotting og in situ ónæmisflúrljómun. MRNA tjáningarstig Lgals1, Rplp1, Col3a1, Col6a2 og Mgp ínýruaf músum greindust með rauntíma PCR. Það eru margar rannsóknarskýrslur sem benda til þess að Col3a1, Col6a2 og Mgp tengist ferli bandvefsmyndunar í nýrum [23, 25, 26]. Hins vegar, fyrir Lgals1 og Rplp1, hafa engar rannsóknir verið gerðar á bandvefsmyndun í nýrum eftir AKI, svo Western blot og in situ ónæmisflúrljómun voru notuð til að sannreyna frekar tjáningu Lgals1 og Rplp1. Eins og sést á mynd 4B, samanborið við venjulega hópinn, var tjáningarmagn Lgals1 og Rplp1 í Cis- AKI og IRI-AKI músum einnig verulega aukið. Ennfremur metum við staðsetningu Lgals1 og Rplp1 með in situ ónæmisflúrljómun. Eins og sýnt er á mynd 5 er Rplp1 aðallega staðsett í gaukla og nýrnapíplum og Lgals1 dreifist í millivefs- og nýrnapíplum. Mikilvægt er að við staðfestum einnig fylgnina á milli Rplp1/Lgals1 og BUN/Cr, og niðurstöðurnar gáfu til kynna að Rplp1/Lgals1 á próteinstigi væri jákvæð fylgni við BUN/Cr (allt R > 0.5,p < 0.05)="" (mynd="">

Umræða

Vaxandi vísbendingar benda til þess að AKI muni að lokum þróast yfir í langvinnan nýrnasjúkdóm/ESRD, með hærri tíðni [4, 27]. Enn sem komið er eru takmarkaðar meðferðir við umskipti frá AKI til CKD [28-30]. Þess vegna er betri skilningur á lífeðlisfræðilegum aðferðum og auðkenning á hugsanlegum lífmerkjum mjög gagnleg til að koma í veg fyrir þessa umskipti og bæta horfur þess. Í þessari rannsókn gerðum við WGCNA til að greina örfylkisgögn sem tengjast umskiptum frá AKI til CKD. Alls fengust 17 einingar og voru 3 helstu genaeiningarnar notaðar til frekari greiningar. Niðurstöður þessarar rannsóknar benda til þess að 3 genaeiningarnar séu náskyldar

Mynd 4. Löggilding á hub genunum í grænblárri mátinu. Magngreining á mRNA tjáningu Lgals1, Col3a1, Rplp1, Mgp og Col6a2 með Q-PCR. B Western blot var notað til að rannsaka tilgreinda próteintjáningu. C Magngreining á tjáningu próteina með skönnun þéttleikamælinga. ***p < 0.001="" borið="" saman="" við="" viðmiðunarhópinn.="" d,="" e="" fylgni="" rplp1/="" lgals1="" og="" bun/cr="" (allt="" r=""> 0,5,p <>

Mynd 5. Staðfesting á staðsetningu hubgenanna í grænblárri einingunni. A, B Staðsetning og tjáning Lgals1 og Rplp1 með in situ ónæmisflúrljómun, í sömu röð.

þróun nýrnatrefjunar eftir AKI í GO flokkun, til dæmis nýrnakerfisþroska, nýrnaæðaþroska [31, 32], sum efnaskiptaferli [33, 34], innri himna hvatbera, innri himna frumulíffæra og ECM [35-37 ]. ECM ójafnvægi er aðalorsök bandvefsmyndunar í nýrum. Eftir AKI verður bandvefsbólga fyrir áhrifum af mörgum þáttum eins og uppsöfnuðum bólgufrumum, virkum vöðvavefjafrumur og svo framvegis [30, 33]. Þess vegna beindi þessi rannsókn að grænblárri einingunni þar sem einingin er nátengd ECM.

Næst síuðum við genin í grænblárri einingunni með því að reikna út GS og síðan með því að búa til PPI netið. Af PPI netinu í grænblárri mátinu má álykta að 6 gen S100a6, Col3a1, Col6a2, Mgp, Rplp1 og Lgals1 sýndu hæstu tengingu við önnur nálæg gen og staðsett í miðju PPI netsins. S100a6 er kóðað með því að vera meðlimur S100 próteinfjölskyldunnar. Greint hefur verið frá því í bókmenntum að S100a6 geti stjórnað frumufjölgun og tekið þátt í ónæmismiðluðum meinafræðilegum ferlum nýrnaþekju-mesenchymal umbreytinga og bandvefs [38, 39]. Col3a1 og Col6a2 eru kollagen tegund III alfa-1 og kollagen tegund VI alfa-2 keðjur, í sömu röð. Þau umrita kollagen, bindast utanfrumuvélapróteinum og eru afar mikilvæg í frumufylkisþáttum. Þegar bandvefsmyndun á sér stað í líffærum eins og lifur og nýrum, er tjáning þessara kollagena aukin, sem er nauðsynleg vísbending til að dæma framvindu sjúkdómsins og athuga meðferðaráhrifin [23, 25]. Mgp, fylki Gla próteins, er meðlimur osteocalcin/Mgp fjölskyldunnar sem er tjáð eftir langvinnan nýrnasjúkdóm og tengist nýrnahorfum [26, 40]. Í samræmi við fyrri rannsóknir leiddu rannsóknir okkar einnig í ljós að S100a6, Col3a1, Col6a2 og Mgp eru hugsanleg snemmgreiningarmerki um bandvefsmyndun í nýrum eftir AKI.

Rplp1, gen sem kóðar ríbósómaprótein sem er hluti af 60S undireiningunni, gegnir mikilvægu hlutverki í lengingarþrepinu við próteinmyndun. Rplp1 er mjög tjáð í mörgum krabbameinsfrumum manna og skortur á því mun hafa áhrif á próteinmyndun, sem leiðir til frumudauða [41, 42]. Lgals1, einnig þekkt sem Galectin-1, er meðlimur -galacto- hlið-bindandi próteinfjölskyldunnar og gegnir hlutverki við að stjórna frumudauði, frumufjölgun og frumuaðgreiningu. Lgals1 er heitur reitur fyrir rannsóknir á sviði æxla og margar nýlegar rannsóknir hafa greint frá því að það gegni einnig mikilvægu hlutverki í ferli vefjamyndunar líffæra. Það hefur verið gefið til kynna að Lgals1 sé mjög tjáð í nýrum af sykursýki af tegund I og tegund II og er nýtt merki um bandvefsmyndun í nýrum [43-45]. Hins vegar er rétt að taka fram að ekki hefur verið greint frá Rplp1 og Lgals1 við bandvefsmyndun í nýrum eftir AKI. Í þessari rannsókn höfum við bráðabirgðasönnun að Rplp1 og Lgals1 gætu verið notuð sem hugsanleg lífmerki í nýrnabandsvefsmyndun eftir AKI með lífupplýsingafræði og tilraunaaðferð. Margar tilraunagreiningar okkar gáfu til kynna að Lgals1 og Rplp1 sýna verulega aukningu í nýrum IRI-AKI og Cis-AKI, og tjáning genanna 2 eykst eftir 3 daga og minnkaði eftir 7 daga, sem er í samræmi við niðurstöðurnar sem greind voru með WGCNA lífupplýsingaaðferðin.

Það skal tekið fram að það eru nokkrar takmarkanir á rannsókninni: Í fyrsta lagi er fjöldi sýna sem notuð eru til greiningar tiltölulega ófullnægjandi sem getur sleppt eða dregið úr nákvæmni greiningarinnar. Í öðru lagi voru miðstöð genin aðeins rannsökuð frekar í AKI nagdýralíkaninu frekar en sýnum úr mönnum sem gæti einnig hindrað þýðingu á niðurstöðunum frá músinni yfir í manninn. Það eru margar rannsóknir á LGALS1 í krabbameini í mönnum og tjáning þess er aukin í nýrnakrabbameini. Miðun á LGALS1 getur hamlað þróun æxla þess. Þrátt fyrir að RPLP1 hafi fundist í legslímuvillu, kvensjúkdómaæxlum og öðrum sjúkdómum, hefur það ekki verið rannsakað í nýrum manna. Frekari rannsóknir á miðstöðgenum á sýnum úr mönnum eins og útskilnaður úr þvagi gæti skýrt betur líffræðilegt hlutverk þeirra klínískt. Að lokum lagði þessi rannsókn grunninn að frekari rannsókn á hlutverki Rplp1 og Lgals1 í AKI.

cistanche dásamlegtfyrirendurheimt nýrna

Ályktanir

Í stuttu máli greindi þessi rannsókn lykilgen tengd AKI í gegnum WGCNA greiningu og fann í tilraunaskyni 2 miðstöð gen með möguleika á frekari rannsóknum, Rplp1 og Lgals1. Hins vegar er sértækur gangur í meingerð AKI enn frekari rannsóknir. Valin mikilvæg frambjóðandi gen veita nýjar rannsóknarleiðbeiningar til að koma í veg fyrir, greiningu, meðferð og horfur á bandvefsmyndun í nýrum.

Yfirlýsing um siðareglur

Öll dýr voru meðhöndluð í samræmi við leiðbeiningar Heilbrigðisstofnunar ríkisins um notkun og umhirðu rannsóknardýra.

Yfirlýsing um hagsmunaárekstra

Höfundar lýstu því yfir að ekki væri um hagsmunaárekstra að ræða.

Fjármögnunarheimildir

Þessi vinna var studd af Luzhou – Southwest Medical Joint Platform Project (2017LZXNYD-P01 og 2018LZXNYD-PT03), byggingarverkefni Sichuan Provincial Key Laboratory of Medicine (2018#53), Sichuan Science and Technology Project (2020YJ0442); sameiginlegur sérstyrkur Luzhou Municipal – Southwest Medical University til kynningar á hæfileikum á háu stigi (Lan Hui-Yao Team); og sameiginlega áætlun Southwest Medical University og Affiliated Traditional Medicine Hospital (2018XYLH-029).

Framlög höfunda

Li Wang og Jianchun Li hugsuðu og samræmdu rannsóknina. Xiao Lin skrifaði blaðið. Jianchun Li endurskoðaði blaðið. Jianchun Li framkvæmdi lífupplýsingagreininguna. Xiao Lin framkvæmdi dýratilraunina og framkvæmdi rauntíma PCR, IHC og IF. Xia Zhong og Jieke Yang framkvæmdu WB og söfnuðu nýrnasýnum frá músum. Ruizhi Tan framkvæmdi tölfræðigreininguna. Allir höfundar fóru yfir niðurstöðurnar og samþykktu lokaútgáfu handritsins.

cistanche fæðubótarefni reynsla af stjórnun nýrnastarfsemi